生物医学工程专业毕业生的主要就业方向为管理机构和国家机关、医学机构、国际制药、保健品企业等。生物医学工程是一门新兴的边缘学科，它综合工程学、物理学、生物学和医学的理论和方法，在各层次上研究人体系统的状态变化，并运用工程技术手段去控制这类变化。
生物医学工程主要研究生命科学、电子技术、计算机技术和信息科学等方面的基本知识和技能，包括生物材料、人工器官、生物医学信号处理方法、医学成像和图像处理方法等。
例如：人工心脏、人工关节等人工器官的研发，脑CT机、核磁共振仪等医疗设备的操纵和维护，B超、核磁共振成像的图像处理等。
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生物医学工程专业毕业生可在管理机构和国家机关，医学机构(临床研究、高度专业化的医学护理，管理) , 在医疗器械的使用、销售和服务上，研究所，大学(基础研究，教学)，国际制药、保健品企业(管理、研究和开发)，私人机构和医生合作。
生物医学工程专业毕业生可直接参加高度专业化的医学护理和解决临床基础研究的问题，由他们研制的器械和系统对于疾病的观察、诊断、治疗、缓解起着很重要的作用。
生物医学工程主要研究生命科学、电子技术、计算机技术和信息科学等方面的基本知识和技能等，是运用现代自然科学和工程技术的原理和方法，从工程学的角度，在多层次上研究人体的结构、功能及其相互关系，揭示其生命现象，为防病、治病提供新的技术手段的一门综合性、高技术的学科。
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