本科一本二本三本的区别在于办学层次、学校的实力和水平、录取分数的不同。目前，我国没有规划大学一本二本三本的，这些都只是民间大众的说法。大学之所以有一本二本三本，是从招生批次中演变而来的。但目前大多数省份已经取消了三本。
1、办学层次
一本、二本和三本之间，其实层次不同办学的水平也是各有不同，实际上在办学实力上是一本＞二本＞三本这样的情况，而这种不同的层次对于高校和学生而言，可以享受到的资源其实也是有很大的不同。
2、学校的实力和水平
虽然同样都是本科的院校，但是，一本二本和三本之间的实力和水平是不一样的，毕竟越高层次的实力自然也就会越来，学生们也能够享受到更好的教育，在高校中也能够学到更多的知识内容。
3、录取分数
学生在填报志愿的时候，也会清楚地发现，其实越好的大学分数线也就越高，所以不用层次的本科院校在招生的录取分数线上其实也是有很大的不同，学生们想要考上更好层次的大学自然也是需要更高的分数。
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一本院校：指的是985工程、211工程院校；省属非211重点大学在全国大多数地区列入本一批的；省属非211原全国重点大学，现仍在本一批招生的；国家部委办直属非211大学按照一本招生的；按照院校根据要求按照一本招生的非211工程大学。
二本院校：指的是录取批次放在第二批的大学。和一本大学相比，二本的师资、硬件等方面还是有一定差距的。对于批次录取的情况，各高校投放到各个省的批次是不一样的。
三本院校：主要是指独立学院，它是“公办民助”或者“纯民办”范畴。与一本二本院校的重要区别还在于其经费来源不是来自国家拨款而是自筹经费，所以在收费上比一二本院校要高一些。
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